手術室淨化程度已達國家最高標準，意味每立升空氣中大於和等於0.3微米的灰塵微粒數目不超過3.5個，由此杜絕由手術環境導致的手術感染，最大限度提高手術品質。另外醫院還採用國內外領先的手術室-供應中心一體化運作模式，手術室、產房與供應中心設電梯直達通道，並分設人流、物流雙通道，為避免院內感染提供硬體上的安全保障。
另外，明基醫院還全面導入支援高效運作的PACS（醫學影像歸檔和通信系統）、LIS（實驗室資訊系統）以及HIS（健康照護資訊系統）等軟體資訊管理系統，覆蓋全院各部門，涵蓋病患來院就診的各個環節，以醫療流程為導向，以病患服務為中心，以內部成本管控為內容，構建起了醫院資訊網路的中樞神經，非但可以真正記錄病人所有就醫資料，為追蹤病人病情、疾病分析統計、科室成本核算、健康檔案建立等，提供流暢的醫療作業流程，未來還可擴展至同體系內的合作醫療機構，在各醫院間即時取得轉診病人的診斷、檢查報告結果等一系列與病患相關的資料。
五星級就醫環境 細節處盡顯人文關懷在整體外觀設計上，南京明基醫院採用歐式古典的建築風格，並被成功塑造為一個充滿自然生態的景觀式醫院，為前來就診的病患，創造出有如五星級賓館客房的舒適度和恍若在家的溫馨感。其26米挑高歐式門診大廳、雙通道扶手電梯，皆給人以現代、恢弘的視覺享受；而開放式掛號、收費與領藥櫃檯，以及一對一的獨立診間，乃至為殘障人員特設的服務專櫃、衛生設施，甚至於專為病患及家屬精心營造的休閒空間等等，無不體現出南京明基醫院對於廣大病患細緻周到的人文關懷。
市級醫保定點醫院 比照三級公立收費為彌補河西醫療資源短缺的現狀，明基醫院初期會將醫療資源集中面向普通市民，而未來則將針對VIP客戶提供進一步的特需醫療，進而將醫療服務做精做細，分別滿足不同群體的需求。日前明基醫院已與南京市醫保結算管理中心，正式簽訂《南京市城鎮職工基本醫療保險定點醫療機構醫療服務協議書》，由此成為南京市城鎮職工基本醫療保險和企業離休幹部醫藥費統籌定點醫療機構，凡參加市級統籌的參保人員均可持醫保卡至明基醫院刷卡就醫。而在醫療服務費用方面，明基醫院將嚴格執行政府指導價格，等同同級公立醫院收費標準，廣大病患將可從中享有超值的醫療服務。而南京衛生行政部門指定明基醫院為河西地區120急救網的配套籌備也正積極完善中。
地鐵專屬通道無縫對接 1200個車位免費停車依託地鐵便捷的交通資源，明基醫院地鐵廣場與地鐵1號線“明基醫院中勝站”實現站內無縫對接，經過專屬通道，病患足不出站，便可直達醫院門診大廳。而經由地鐵新街口站抵達明基醫院中勝站，大約只需13分鐘的時間。目前，醫院一期還悉心提供免費停車位1200個，可有效解決民眾就醫停車的後顧之憂。
明基醫院立足南京 放眼世界明基醫院周德陽院長表示：“明基醫院將聯合兩岸醫療精英，打造全國頂尖的醫療技術平臺，並將積極從事臨床教學及科研，不斷塑造和培養各學科專業人才，為百姓提供最優質的醫療服務。”明基醫院執行長陳貽善博士說：“明基醫院未來將成為兩岸醫療服務的標杆，目標是成為世界級的醫學中心，與BenQ品牌一起揚名世界。”
明基醫院董事長雷輝先生，則以明基友達集團的角度坦言，放眼未來產業願景，我們將以南京明基醫院為平臺，結合集團在資訊產業的領導優勢，在未來十年內為集團開拓出生物科技新的事業領域。
